RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 EGLN3Q9H6Z9 239 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A14Q9HCY8 104 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SIGLEC7Q9Y286 467 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CACNA1CQ13936 2221 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 A6NIZ1 184 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 H0YHG0 523 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SOCS2O14508 198 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGEF9O43307 516 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 KLF4O43474 513 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CD14P08571 375 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 PRF1P14222 555 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV1-2P23083 117 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS6KA3P51812 740 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 RAP1BP61224 184 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 RAP1AP62834 184 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 MYBPC1Q00872 1141 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TGFBR3Q03167 851 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF620Q6ZNG0 422 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM123Q8N131 208 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 GABRG1Q8N1C3 465 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 STEAP2Q8NFT2 490 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ASB10Q8WXI3 467 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 S100PBPQ96BU1 408 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 PKP2Q99959 881 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 HDHD5Q9BXW7 423 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 RERGLQ9H628 205 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CRLF2Q9HC73 371 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 MALT1Q9UDY8 824 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SH3D21A4FU49 640 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ARRDC5A6NEK1 342 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BNX3 289 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 H7C1C5 153 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CASKO14936 926 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 PTP4A3O75365 173 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF432O94892 652 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ANXA8P13928 327 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ACADSP16219 412 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 MPGP29372 298 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 PEX19P40855 299 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 LCN6P62502 163 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SORDQ00796 357 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 RFX4Q33E94 735 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SFRP5Q5T4F7 317 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM205BPQ63HN1 556 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SVOPLQ8N434 492 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01560Q8TB33 94 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 RASD2Q96D21 266 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 NRBF2Q96F24 287 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 Q96M85 177 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 DGCR6LQ9BY27 220 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00470Q9BZP3 86 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 NTN4Q9HB63 628 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR35Q9HC97 309 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 GLTPQ9NZD2 209 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR52Q9Y2T5 361 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A096LPE4 126 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PPZ6 126 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SEC14L2O76054 403 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 QDPRP09417 244 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 TSPAN19P0C672 248 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 NR2C1P13056 603 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 CAPZA2P47755 286 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 RUNX1T1Q06455 604 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 FHL1Q13642 323 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms