RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CD300AQ9UGN4 299 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 KPTNQ9Y664 436 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 AKNAQ7Z591 1439 aa3.76□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CENPXA8MT69 81 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 A8MX80 341 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GPAA1O43292 621 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SCRG1O75711 98 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SLC2A10O95528 541 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 C1orf105O95561 183 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CLIC3O95833 236 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 HLA-HP01893 362 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SERPINE2P07093 398 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 ADORA2BP29275 332 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 DDOSTP39656 456 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GPR4P46093 362 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A1P53007 311 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 FBXW4P57775 412 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 TRDNQ13061 729 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 MARC1Q5VT66 337 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CERS6Q6ZMG9 384 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GPD1LQ8N335 351 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SVOPLQ8N434 492 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CXorf40AQ8TE69 158 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 FGF11Q92914 225 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 OR8B4Q96RC9 309 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SORT1Q99523 831 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 ACTR6Q9GZN1 396 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 OR2AG1Q9H205 316 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 TMEM165Q9HC07 324 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.75□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PQ72 361 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 H7C0C1 242 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CCL21O00585 134 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SIVA1O15304 175 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CHST1O43916 411 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GPX5O75715 221 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SCELO95171 688 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 TSPAN13O95857 204 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 KRT16P08779 473 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GCKP35557 465 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GPR1P46091 355 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CXCL6P80162 114 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 LCN2P80188 198 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 ZNF33AQ06730 810 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 PRDM2Q13029 1718 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 XRCC4Q13426 336 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 COTL1Q14019 142 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 DPYSL3Q14195 570 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 MARCH8Q5T0T0 291 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SPESP1Q6UW49 350 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 Q6ZN92 141 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 ARCQ7LC44 396 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 FTMTQ8N4E7 242 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 OR56B4Q8NH76 319 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 GTSF1Q8WW33 167 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 NAT6Q93015 286 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 APH1AQ96BI3 265 aa3.74□□□□□ -1.81
CCL20-204ENST00000489160 OXGR1Q96P68 337 aa3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms