RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.56□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.56□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF580Q9UK33 172 aa4.56□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CA5BQ9Y2D0 317 aa4.56□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.56□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 LRP4O75096 1905 aa4.56□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 HCFC1P51610 2035 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 L7N2F9 121 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 HIP1O00291 1037 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ACOT8O14734 319 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TAPBPO15533 448 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TYROBPO43914 113 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 LY6G6DO95868 133 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TPM1P09493 284 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC130P13994 396 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ETS2P15036 469 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 HLCSP50747 726 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 PHEXP78562 749 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TIGITQ495A1 244 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM120AOSQ5T036 256 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM219BQ5XKK7 198 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 GCNT7Q6ZNI0 430 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 BBOF1Q8ND07 529 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 STARD8Q92502 1023 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 PANX1Q96RD7 426 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 COPS8Q99627 209 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 BBS2Q9BXC9 721 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 GALPQ9UBC7 116 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ALG6Q9Y672 507 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 V9GYY5 206 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A087X002 238 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SMCO2A6NFE2 343 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ERICH4A6NGS2 130 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SLCO1B7G3V0H7 640 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP8B1O43520 1251 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 LATO43561 262 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT36O76013 467 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 LRATO95237 230 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHG1P01857 330 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 FCGR3AP08637 254 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 H2BFMP0C1H6 154 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 BCKDHAP12694 445 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CCL4P13236 92 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TCN2P20062 427 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
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STRADBP1-201ENST00000478954 EFNB2P52799 333 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SMARCB1Q12824 385 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 NECTIN1Q15223 517 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R7Q15435 360 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ACER2Q5QJU3 275 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 MUC21Q5SSG8 566 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM215Q68D42 235 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM135Q86UB9 458 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM110BQ8TC76 370 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 FNDC8Q8TC99 324 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SDSLQ96GA7 329 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 DUSP16Q9BY84 665 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 NEUROG2Q9H2A3 272 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 GLIPR2Q9H4G4 154 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 NEK6Q9HC98 313 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 RASD1Q9Y272 281 aa4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 USF3Q68DE3 2245 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 MEIOCA2RUB1 952 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 MPTX1A8MV57 137 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf98E9PRG8 122 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 RAD1O60671 282 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 RAMP1O60894 148 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CST1P01037 141 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CRYGBP07316 175 aa4.53□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.53□□□□□ -1.68
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