RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 OAFQ86UD1 273 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDH24Q86UP0 819 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDK20Q8IZL9 346 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00471Q8N535 108 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2T29Q8NH02 315 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 MBD6Q96DN6 1003 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 MUCL1Q96DR8 90 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRGUKQ96M69 825 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 KCNK17Q96T54 332 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPA33Q99795 319 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ALG12Q9BV10 488 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 EMC6Q9BV81 110 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ABCA4P78363 2273 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPG11Q96JI7 2443 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 CIB4A0PJX0 185 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 A6NIZ1 184 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 MCIDASD6RGH6 385 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 M0R3G1 203 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 AHCYL1O43865 530 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ENTPD5O75356 428 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 PTP4A3O75365 173 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 KRT33AO76009 404 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 NDUFB2O95178 105 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 STAMBPO95630 424 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 TXNDC12O95881 172 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 BCL10O95999 233 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 WNT11O96014 354 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGKV3-15P01624 115 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD14P08571 375 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ACADSP16219 412 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 HOXC12P31275 282 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFNGR2P38484 337 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAP1BP61224 184 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAP1AP62834 184 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 BSPH1Q075Z2 132 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSPAN31Q12999 210 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 CAMK2DQ13557 499 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADCK1Q86TW2 530 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR52J3Q8NH60 311 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 FANK1Q8TC84 345 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 FNDC8Q8TC99 324 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOXB1Q99853 325 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 GLTPQ9NZD2 209 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 AKAP9Q99996 3911 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 DPRXA6NFQ7 191 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 UNC119BA6NIH7 251 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF726A6NNF4 738 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 SHISA9B4DS77 424 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 TNFRSF11BO00300 401 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 HS3ST1O14792 307 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARPC3O15145 178 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 DHHO43323 396 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 MGRN1O60291 552 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR10H3O60404 316 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMCC2O75069 709 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 SERPINI2O75830 405 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATE1O95260 518 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms