RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SYT14	Q8NB59	555 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ASB10	Q8WXI3	467 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CDC42EP2	O14613	210 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ABCD4	O14678	606 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OR10H3	O60404	316 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ATP5H	O75947	161 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	RAF1	P04049	648 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN19	P0C672	248 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ACADS	P16219	412 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	IST1	P53990	364 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	MYBPC1	Q00872	1141 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TAF11	Q15544	211 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZBED5	Q49AG3	693 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TMEM54	Q969K7	222 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	HIVEP1	P15822	2718 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ACOT8	O14734	319 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	GSC2	O15499	205 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	QDPR	P09417	244 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PGA4	P0DJD7	388 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PGA3	P0DJD8	388 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PTAFR	P25105	342 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ACVR1B	P36896	505 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	IFNGR2	P38484	337 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OMP	P47874	163 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	RUNX1T1	Q06455	604 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	CD47	Q08722	323 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	FLOT2	Q14254	428 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A25	Q6T423	547 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	SPATA24	Q86W54	205 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
USP19-210	ENST00000465902	PLCE1	Q9P212	2302 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	UNC119B	A6NIH7	251 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF11B	O00300	401 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	KRT36	O76013	467 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	B4GALT1	P15291	398 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CD40	P25942	277 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ERVK-25	P63136	954 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NEUROG1	Q92886	237 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NINJ1	Q92982	152 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RADIL	Q96JH8	1075 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FOXB1	Q99853	325 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FUZ	Q9BT04	418 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NELFA	Q9H3P2	528 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ARID1A	O14497	2285 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	AQP12B	A6NM10	295 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	HS3ST1	O14792	307 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	DHH	O43323	396 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB2	O95178	105 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RAP2A	P10114	183 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CD79A	P11912	226 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	LIMS1	P48059	325 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ERF	P50548	548 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF84	P51523	738 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SPOCK1	Q08629	439 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FHL1	Q13642	323 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		15.5	■□□□□ 0.07

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