RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MUCL1Q96DR8 90 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PERPQ96FX8 193 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 NSL1Q96IY1 281 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 LRR1Q96L50 414 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF347Q96SE7 839 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL19Q99731 98 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PIP5K1AQ99755 562 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SMR3AQ99954 134 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MOKQ9UQ07 419 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MED31Q9Y3C7 131 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF726A6NNF4 738 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ARPC2O15144 300 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PTP4A3O75365 173 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 DCTN3O75935 186 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT33AO76009 404 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 IGF2P01344 180 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV1-44P01699 117 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNW1P05000 195 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SCG5P05408 212 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CECR9P0C854 216 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 THRBP10828 461 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR4P46093 362 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 OMPP47874 163 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH11P55287 796 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPS1P60891 318 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 HGFACQ04756 655 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGFQ07326 219 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAM2Q15035 370 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST3H3Q16695 136 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 DTX2Q86UW9 622 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 MDP1Q86V88 176 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SKA3Q8IX90 412 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 NRMQ8IXM6 262 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 SYT14Q8NB59 555 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51A7Q8NH64 312 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6X1Q8NH79 312 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXW5Q969U6 566 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 PYURFQ96I23 114 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 GLTPQ9NZD2 209 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA1O95477 2261 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM129A0AVI4 362 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM64BA6NI03 449 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MCIDASD6RGH6 385 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SMPD2O60906 423 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE5AO76074 875 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 UBOX5O94941 541 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6A2O95222 327 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A10O95528 541 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 BCL10O95999 233 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV3-15P01624 115 aa6.08□□□□□ -1.44
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