RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 NOX3Q9HBY0 568 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 CA10Q9NS85 328 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 GLTPQ9NZD2 209 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 MED31Q9Y3C7 131 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 GMNCA6NCL1 334 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 PIP5K1CO60331 668 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF682O95780 498 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 IFNW1P05000 195 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 TSPAN19P0C672 248 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 PRDX6P30041 224 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 PSME3P61289 254 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 ST3GAL3Q11203 375 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 MST1LQ2TV78 715 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 LRFN4Q6PJG9 635 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 CBLL1Q75N03 491 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 HTRA1Q92743 480 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF224Q9NZL3 707 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 RNF223E7ERA6 249 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 NDUFAB1O14561 156 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 BCL10O95999 233 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 F13BP05160 661 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 PGA4P0DJD7 388 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 PGA3P0DJD8 388 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 HGFACQ04756 655 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 CHRNB3Q05901 458 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO17Q96EF6 278 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 J3KTA2 159 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 FFAR1O14842 300 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 SSX4O60224 188 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINA1P01009 418 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 AQP2P41181 271 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 RUNX1T1Q06455 604 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 RAB35Q15286 201 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 OR4F15Q8NGB8 312 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 MOSPD2Q8NHP6 518 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF75AQ96N20 296 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 RHCGQ9UBD6 479 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 CD79AP11912 226 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 NCK1P16333 377 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 NUDT6P53370 316 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 GSG1Q2KHT4 349 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 IFI44LQ53G44 452 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 NUP37Q8NFH4 326 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 ASB10Q8WXI3 467 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 REG4Q9BYZ8 158 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 INIPQ9NRY2 104 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PRG6 482 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 IGHG1P01857 330 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 BMP4P12644 408 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 IFNA8P32881 189 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINF1P36955 418 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 GNGT1P63211 74 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 PIGFQ07326 219 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 ADIPOQQ15848 244 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 HIST3H3Q16695 136 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 SEPHS2Q99611 448 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 FNDC11Q9BVV2 318 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 MCIDASD6RGH6 385 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 DHHO43323 396 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 PDE5AO76074 875 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 PRSS23O95084 383 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 OR4A8P0C604 315 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 LAPTM4AQ15012 233 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 VHLLQ6RSH7 139 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 FKBP9P1Q75LS8 142 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 IL17RDQ8NFM7 739 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 FAM162AQ96A26 154 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 MS4A3Q96HJ5 214 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF347Q96SE7 839 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM38BQ9NVV0 291 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 QDPRP09417 244 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 IFI30P13284 250 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 MAKP20794 623 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 GIPRP48546 466 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 DAP3P51398 398 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 CLRN1P58418 232 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 KRTAP1-1Q07627 177 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXB3-202ENST00000460160 TRAM2Q15035 370 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms