RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TAAR8Q969N4 342 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 GPR137Q96N19 417 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 OR8D2Q9GZM6 311 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 LIN7BQ9HAP6 207 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 HSPB11Q9Y547 144 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 SPEGQ15772 3267 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 MEIKINA0A087WXM9 373 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 OR4C45A6NMZ5 311 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 IDSB3KWA1 339 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 TGM6O95932 706 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 OR8G3PP0DMU2 310 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 PRKCAP17252 672 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 CXCR1P25024 350 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 PNLIPRP2P54317 469 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 ZNF117Q03924 483 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 IKZF1Q13422 519 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 EBPQ15125 230 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 HES5Q5TA89 166 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 OLFML2AQ68BL7 652 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 CCDC74AQ96AQ1 378 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 RADILQ96JH8 1075 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 ADOQ96SZ5 270 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 COMMD4Q9H0A8 199 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 FKBP7Q9Y680 259 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 PI4KAP42356 2102 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 PEX14O75381 377 aa21.53■■□□□ 1.04
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PMS1-205ENST00000409985 IL12BP29460 328 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 ART1P52961 327 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 TTLL10Q6ZVT0 673 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 FCRLAQ7L513 359 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 LINGO2Q7L985 606 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 LRRTM1Q86UE6 522 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 OR6V1Q8N148 313 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 ASB17Q8WXJ9 295 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 TTC9Q92623 222 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 PHF21AQ96BD5 680 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 MED30Q96HR3 178 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 INTS14Q96SY0 518 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 ZFP64Q9NPA5 681 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 OR5V1Q9UGF6 321 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 FBXL3Q9UKT7 428 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 FOXJ3Q9UPW0 622 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-205ENST00000409985 NPTNQ9Y639 398 aa21.53■■□□□ 1.04
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.52■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 SLC25A18Q9H1K4 315 aa21.52■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 FAM109AQ8N4B1 249 aa21.51■■□□□ 1.03
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 GIMAP1Q8WWP7 306 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TSLPQ969D9 159 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 C20orf85Q9H1P6 137 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 AUNIPQ9H7T9 357 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R5Q9NYW4 299 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-205ENST00000409985 AKR7A2O43488 359 aa21.5■■□□□ 1.03
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