RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 TVP23AA6NH52 213 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 H7C417 338 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 L7N2F9 121 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF264O43296 627 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ALOX5APP20292 161 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MST1P26927 711 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TCTN2Q96GX1 697 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 FKRPQ9H9S5 495 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 C10orf142B7Z368 130 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 H7C1C5 153 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 RBBP9O75884 186 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 IGHV4-34P06331 123 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CSF1P09603 554 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 LCN6P62502 163 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CBLN3Q6UW01 205 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 INTS14Q96SY0 518 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 C12orf10Q9HB07 376 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 UBE2QL1A1L167 161 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CXCL2P19875 107 aa16.54■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 C3P1Q6ZMU1 363 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SIX5Q8N196 739 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SFXN2Q96NB2 322 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 GGT3PA6NGU5 568 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR6C65A6NJZ3 312 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 B4DGG1 531 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 UTS2O95399 124 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2ABP04908 130 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF250P15622 560 aa16.54■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 DLX5P56178 289 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 NHLRC3Q5JS37 347 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MCHR2Q969V1 340 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MSANTD3Q96H12 275 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC120Q96HB5 630 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 C4orf45Q96LM5 186 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GTH9 108 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 C17orf105B2RV13 164 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa16.53■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 BIKQ13323 160 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 C1orf61Q13536 156 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.53■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 OR4C16Q8NGL9 310 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR10AC1Q8NH08 325 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF563Q8TA94 476 aa16.53■□□□□ 0.24
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SPNS3-201ENST00000355530 SYT4Q9H2B2 425 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 EPOPA6NHQ4 379 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 THEGLP0DJG4 465 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TACR3P29371 465 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PPICP45877 212 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 FDX2Q6P4F2 183 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PARGQ86W56 976 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 FRMD1Q8N878 549 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
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