RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 FGF17O60258 216 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 DNAJB6O75190 326 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CTSAP10619 480 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 LCN10Q6JVE6 187 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PRSS41Q7RTY9 318 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TMIEQ8NEW7 156 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR1J2Q8NGS2 313 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MARVELD3Q96A59 401 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PCDHB10Q9UN67 800 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TMEM235A6NFC5 223 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF98A6NK75 572 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 AVPR2P30518 371 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ARL4DP49703 201 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ARFRP1Q13795 201 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF585AQ6P3V2 769 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TTLL10Q6ZVT0 673 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF485Q8NCK3 441 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 FAM71CQ8NEG0 241 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 GAL3ST3Q96A11 431 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 APMAPQ9HDC9 416 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 BIN3Q9NQY0 253 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR6C68A6NDL8 312 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PDZK1IP1Q13113 114 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 GLYATL3Q5SZD4 288 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR1S2Q8NGQ3 325 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZPLD1Q8TCW7 415 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 HAVCR1Q96D42 359 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 EMC3Q9P0I2 261 aa13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR4E1P0C645 316 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 GPR143P51810 404 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 LHX8Q68G74 356 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 RAB11FIP2Q7L804 512 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF417Q8TAU3 575 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ARL11Q969Q4 196 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 FAM3DQ96BQ1 224 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TMEM41AQ96HV5 264 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 UQCC2Q9BRT2 126 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ELOVL3Q9HB03 270 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC22A13Q9Y226 551 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SDK2Q58EX2 2172 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TMEM200CA6NKL6 621 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PRH1P02810 166 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 GALP22466 123 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 DUSP8Q13202 625 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 IGSF11Q5DX21 431 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ULK3Q6PHR2 472 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR5M9Q8NGP3 310 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC9A3R2Q15599 337 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 KIRREL2Q6UWL6 708 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF550Q7Z398 422 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 KDM8Q8N371 416 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MIB2Q96AX9 1013 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC25A38Q96DW6 304 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TNFSF12O43508 249 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 GLI4P10075 376 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF136P52737 540 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 OR8D2Q9GZM6 311 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 NIT2Q9NQR4 276 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC22A11Q9NSA0 550 aa13.98□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TRAV20A0A0B4J274 112 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PPV9 198 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 SNRPGP15A8MWD9 76 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF208O43345 1280 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 LILRB5O75023 590 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 EFNB2P52799 333 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 RUNX2Q13950 521 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 MYADMQ96S97 322 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 C20orf24Q9BUV8 137 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa13.97□□□□□ -0.17
USP25-201ENST00000285679 TSPAN11A1L157 253 aa13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms