RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 PGGHGQ32M88 737 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 MESTQ5EB52 335 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 ZNF610Q8N9Z0 462 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 RASD2Q96D21 266 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 KCNK17Q96T54 332 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 MALT1Q9UDY8 824 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 PRSS50Q9UI38 385 aa20.89■□□□□ 0.94
RAB20-201ENST00000267328 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 WIPF3A6NGB9 483 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 A8MXE2 369 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 NPRL3Q12980 569 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 GINS1Q14691 196 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 FBXW9Q5XUX1 488 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 NOXO1Q8NFA2 376 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 NRG4Q8WWG1 115 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 TMEM54Q969K7 222 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ALG12Q9BV10 488 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 EPHA2P29317 976 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 NOS3P29474 1203 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 GRK5P34947 590 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CSNK1A1P48729 337 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CDSNQ15517 529 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 HIST3H3Q16695 136 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CARD17Q5XLA6 110 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ACSM5Q6NUN0 579 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ADCK1Q86TW2 530 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 RDH12Q96NR8 316 aa20.88■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ZAR1LA6NP61 321 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 XKRYO14609 159 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 UPK3AO75631 287 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 MYBPC1Q00872 1141 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 Q6ZT83 130 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 BEND4Q6ZU67 534 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 LUZP2Q86TE4 346 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 SNX18Q96RF0 628 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 GLTPQ9NZD2 209 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 UPB1Q9UBR1 384 aa20.87■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 FLNCQ14315 2725 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 E9PQ18 207 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 DLGAP1O14490 977 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ARHGEF9O43307 516 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 AHCYL1O43865 530 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 AGFG2O95081 481 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 IGHV3-9P01782 118 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ASCL1P50553 236 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CLRN1P58418 232 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 LGALS3BPQ08380 585 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 PHYHD1Q5SRE7 291 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 GABRG1Q8N1C3 465 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 GPR137CQ8N3F9 429 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 TOR3AQ9H497 397 aa20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 PRSS37A4D1T9 235 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 FAM90A27PA6NNH2 459 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 SNAP29O95721 258 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 LINGO2Q7L985 606 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 SYT14Q8NB59 555 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 FNDC8Q8TC99 324 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 MBOAT4Q96T53 435 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ASB6Q9NWX5 421 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CACNA1CQ13936 2221 aa20.85■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 M0R3G1 203 aa20.84■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 CLDN14O95500 239 aa20.84■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 HMGN1P05114 100 aa20.84■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 NR2C1P13056 603 aa20.84■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.84■□□□□ 0.93
RAB20-201ENST00000267328 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms