RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 EMDP50402 254 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MTCP1P56278 107 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SELENOVP59797 346 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TNK1Q13470 666 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BAK1Q16611 211 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HBMQ6B0K9 141 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM198BQ6UWH4 519 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RTL10Q7L3V2 364 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF546Q86UE3 836 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NAT6Q93015 286 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SPTSSAQ969W0 71 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF566Q969W8 418 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DERL3Q96Q80 235 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF649Q9BS31 505 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C1orf198Q9H425 327 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 EHFQ9NZC4 300 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NEU3Q9UQ49 428 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 F5H5P2 479 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CCSO14618 274 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PHYHO14832 338 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 P2RX6O15547 441 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ALOX12BO75342 701 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RFPL3O75679 317 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TCRBP04435 133 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GUSBP08236 651 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 AKAIN1P0CW23 69 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FCGR2AP12318 317 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CD53P19397 219 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HOXC8P31273 242 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DGCR2P98153 550 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ACKR1Q16570 336 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C3orf33Q6P1S2 294 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OPN5Q6U736 354 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEM92Q6UXU6 159 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MOB3CQ70IA8 216 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 AAED1Q7RTV5 226 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 COMMD7Q86VX2 200 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM71CQ8NEG0 241 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEM185AQ8NFB2 350 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR5H6Q8NGV6 325 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OPALINQ96PE5 141 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM60AQ9NP50 221 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PADI1Q9ULC6 663 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GTH9 108 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM221AA4D161 298 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 A6NIZ1 184 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM166BA8MTA8 275 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TNFRSF10CO14798 259 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GPRIN2O60269 458 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ICOSLGO75144 302 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 EML2O95834 649 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GPANK1O95872 356 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OLFM2O95897 454 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ABOP16442 354 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SRMP19623 302 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 COL9A1P20849 921 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DLSTP36957 453 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DLX5P56178 289 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PRSS12P56730 875 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CLDN6P56747 220 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RAP1BP61224 184 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RAP1AP62834 184 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DUSP2Q05923 314 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HYAL1Q12794 435 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms