RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ighv16-1A0A0A6YW39 117 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FcmrA1KXC4 422 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam71dD3YV92 440 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nfatc1O88942 717 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpl18P35980 188 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elk1P41969 429 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RoraP51448 523 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab2bP59279 216 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Perm1Q149B8 807 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Faap20Q3UN58 186 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acvr1bQ61271 505 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptpn21Q62136 1176 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc6a7Q6PGE7 637 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tm7sf2Q71KT5 418 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Catsper4Q8BVN3 442 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Iglon5Q8HW98 336 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr769Q8K501 312 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rdh10Q8VCH7 341 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr164Q8VF87 315 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr668Q8VGW3 318 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dusp22Q99N11 184 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pfn4Q9D6I3 129 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acox3Q9EPL9 700 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lancl2Q9JJK2 450 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ascl3Q9JJR7 174 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxo1Q9R1E0 652 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Deaf1Q9Z1T5 566 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CtcflA2APF3 636 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1314A2AVL6 312 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scgb2b3D2XZ38 112 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp712E9PXJ4 705 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01808 119 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 S100a13P97352 98 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FrzbP97401 323 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wfdc5Q4KXB6 126 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mettl7a2Q5I0W6 244 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 St8sia4Q64692 359 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Npr2Q6VVW5 1047 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LssQ8BLN5 733 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RybpQ8CCI5 228 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Saysd1Q8K190 188 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Swi5Q8K3D3 89 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r192Q8K4C9 300 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syngr3Q8R191 229 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r42Q8VBS7 329 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr558Q8VGZ7 317 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Txndc17Q9CQM5 123 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Jam3Q9D8B7 310 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prkar1aQ9DBC7 381 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klhl1Q9JI74 751 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrps34Q9JIK9 218 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il36aQ9JLA2 160 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm266A6H634 200 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lao1B1ARV3 523 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm8159E9Q0R1 267 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prr22F6TNE3 422 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prps1l3G3UXL2 318 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01661 131 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01662 111 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01663 111 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mst1P26928 716 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Capza2P47754 286 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ctbp2P56546 445 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elavl1P70372 326 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cuzd1P70412 606 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wbp1P97764 304 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cnn2Q08093 305 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc28Q3TX51 367 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc5a6Q5U4D8 634 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Doxl2Q6IMK7 723 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AasdhQ80WC9 1100 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GskipQ8BGR8 139 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp1r3bQ8C767 284 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem198bQ8CFU0 350 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il17rcQ8K4C2 698 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lsm10Q8QZX5 122 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccm2lQ8VCC6 481 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr99Q8VFE4 305 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1346Q8VGH6 313 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RabifQ91X96 123 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gtpbp8Q9CY28 285 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dusp12Q9D0T2 339 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prps1Q9D7G0 318 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr2Q9QWU6 327 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr545Q9WU94 316 aa9.32□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tns1E9Q0S6 1888 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm29106A0A087WSP8 697 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psmd4O35226 376 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TP20293 436 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Defa-rs12P50716 91 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sult2a1P52843 285 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdk5r1P61809 307 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 S100gP97816 79 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fthl17dQ3SXD1 176 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EgflamQ4VBE4 1017 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HpQ61646 347 aa9.31□□□□□ -0.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sema3bQ62177 748 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.3 ms