RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638694.1

GLDC-209, Transcript of glycine decarboxylase, human

TSL 5

Gene GLDC, Length 1,614 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLDC-209	ENST00000638694	LGI1	O95970	557 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	NAAA	Q02083	359 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	EPS8	Q12929	822 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	FXN	Q16595	210 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	VHLL	Q6RSH7	139 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	POMP	Q9Y244	141 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694		A0A0G2JPF8	293 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	CECR9	P0C854	216 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	IL7R	P16871	459 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	CXCR1	P25024	350 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	GIF	P27352	417 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	KDELR2	P33947	212 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	CHN2	P52757	468 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	BNIP2	Q12982	314 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SPATS1	Q496A3	300 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	VRK2	Q86Y07	508 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	BBS10	Q8TAM1	723 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	HPS1	Q92902	700 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	FAM162A	Q96A26	154 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TAMM41	Q96BW9	452 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TPST1	O60507	370 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	VAMP5	O95183	116 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	STAMBP	O95630	424 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	IGLV1-44	P01699	117 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TACSTD2	P09758	323 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	DAO	P14920	347 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SELENOP	P49908	381 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	CCDC80	Q76M96	950 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	COMTD1	Q86VU5	262 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	DHFR2	Q86XF0	187 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	NUP37	Q8NFH4	326 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ASB9	Q96DX5	294 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ADAM19	Q9H013	955 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	CALML5	Q9NZT1	146 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694		V9GYQ6	96 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	FRS3	O43559	492 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	MFN2	O95140	757 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SERPINA1	P01009	418 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	IGKV3-15	P01624	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ETS2	P15036	469 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	ITGA2	P17301	1181 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	CALCR	P30988	508 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	P2RY4	P51582	365 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TUBA1B	P68363	451 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TUBA4A	P68366	448 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	DUSP7	Q16829	419 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	TUBA1A	Q71U36	451 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GLDC-209	ENST00000638694	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		10.18	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms