RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	TM4SF5	O14894	197 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	RAD1	O60671	282 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	RCBTB2	O95199	551 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	CRYZL1	O95825	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	MT-ND5	P03915	603 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	OR3A3	P47888	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	IL10RA	Q13651	578 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	GALE	Q14376	348 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	SSPN	Q14714	243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM99	Q8N816	258 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	STMND1	H3BQB6	276 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	ITGA10	O75578	1167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	IFI30	P13284	250 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	HK1	P19367	917 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	FUT1	P19526	365 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC6A1	P30531	599 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR176	Q14439	515 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	NACC2	Q96BF6	587 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	C21orf140	B9A014	251 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	BHLHE40	O14503	412 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	NAGA	P17050	411 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	NPR2	P20594	1047 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	MAK	P20794	623 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	CDK20	Q8IZL9	346 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	LNX2	Q8N448	690 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR87	Q9BY21	358 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	STMN3	Q9NZ72	180 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-208	ENST00000638481	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CEACAM1	P13688	526 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PITPNB	P48739	271 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481		Q0VFX4	171 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	IKZF1	Q13422	519 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ARL9	Q6T311	187 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OAF	Q86UD1	273 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CMC2	Q9NRP2	79 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A087WUJ7	227 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	AKR7A2	O43488	359 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PLPP2	O43688	288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DHFR	P00374	187 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ITPKB	P27987	946 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SHC1	P29353	583 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NTRK2	Q16620	822 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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