RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5L1Q8NGL2 311 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJB11Q9UBS4 358 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SPTA1P02549 2419 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 BPNT1O95861 308 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ALDOBP05062 364 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK2P24941 298 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS19P39019 145 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ETV5P41161 510 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ETV1P50549 477 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PDZD9Q8IXQ8 264 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 STEAP2Q8NFT2 490 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 OR6F1Q8NGZ6 308 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRNA9Q9UGM1 479 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 P2RY10O00398 339 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 GAAP10253 952 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 LCN10Q6JVE6 187 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PAQR6Q6TCH4 344 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 EMC6Q9BV81 110 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SEMA4CQ9C0C4 833 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CMC2Q9NRP2 79 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ENPP1P22413 925 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 HTR2AP28223 471 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 RRADP55042 308 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 MTCP1P56278 107 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R35Q8TAP8 253 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0A6YYD5 115 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PIPP12273 146 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PTGS2P35354 604 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 GP2P55259 537 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 DLX5P56178 289 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC61Q9BV99 259 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 MED16Q9Y2X0 877 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 GDNFP39905 211 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CAV2P51636 162 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC28AQ8IWP9 274 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAAF1Q8NEP3 725 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CALHM2Q9HA72 323 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SMCO3A2RU48 225 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 APOC3P02656 99 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 VEGFCP49767 419 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 RPL27P61353 136 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PSPHP78330 225 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 GABREP78334 506 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 MFFQ9GZY8 342 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 B4DXG7 233 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINE2P07093 398 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 EFNA3P52797 238 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 MPEG1Q2M385 716 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PRSS36Q5K4E3 855 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 LYPD4Q6UWN0 246 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC16A9Q7RTY1 509 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SIRT6Q8N6T7 355 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5M1Q8NGP8 315 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 NIPAL2Q9H841 368 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CD1EP15812 388 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 NKG7Q16617 165 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 YIF1BQ5BJH7 314 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 LIPNQ5VXI9 398 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 DCXRQ7Z4W1 244 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 IL1F10Q8WWZ1 152 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM59Q9BXS4 323 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 UBL3O95164 117 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRNB1P11230 501 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 FCGR2AP12318 317 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 MYF5P13349 255 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 DRD3P35462 400 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF695Q8IW36 515 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM99Q8N816 258 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB8AQ96BR9 441 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 NICN1Q9BSH3 213 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF167Q9H6Y7 350 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SPDEFO95238 335 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 DCUN1D4Q92564 292 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL5BQ96KC2 179 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PLSCR5A0PG75 271 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 FAHD1Q6P587 224 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF767PQ75MW2 155 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms