RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.61■□□□□ 0.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-208ENST00000558954 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-208ENST00000558954 CADP27708 2225 aa16.61■□□□□ 0.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 GK3PQ14409 553 aa16.58■□□□□ 0.24
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RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf146Q5VVC0 180 aa16.58■□□□□ 0.24
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RABGGTA-208ENST00000558954 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 OR1K1Q8NGR3 316 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa16.58■□□□□ 0.24
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RABGGTA-208ENST00000558954 NR2C1P13056 603 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGGTA-208ENST00000558954 CTXN1P60606 82 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGGTA-208ENST00000558954 ALKBH2Q6NS38 261 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 IGFN1Q86VF2 1251 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 WDFY1Q8IWB7 410 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 BOD1Q96IK1 185 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 GLTPQ9NZD2 209 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-208ENST00000558954 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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