RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 CCL7P80098 99 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CDC20Q12834 499 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.922e-7■■■■□ 22.2
CS-232ENST00000552331 GPR18Q14330 331 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LAGE3Q14657 143 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 MTF1Q14872 753 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 HLFQ16534 295 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 POU2AF1Q16633 256 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TRIM16LQ309B1 348 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RFX4Q33E94 735 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 METTL7BQ6UX53 244 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 Q6ZSV7 163 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 BBS7Q8IWZ6 715 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 OR2L13Q8N349 312 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LFNGQ8NES3 379 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 OR2T12Q8NG77 320 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 OR5K2Q8NHB8 316 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TOMM40LQ969M1 308 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLC35B4Q969S0 331 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 NTAN1Q96AB6 310 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 OMA1Q96E52 524 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CSF3RQ99062 836 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 EPYCQ99645 322 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TMBIM4Q9HC24 238 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 C19orf12Q9NSK7 152 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SPATA2Q9UM82 520 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 STYXL1Q9Y6J8 313 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ELP1O95163 1332 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ABCB11O95342 1321 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 PRR23AA6NEV1 266 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TVP23AA6NH52 213 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 OR5B21A6NL26 309 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TMEM238C9JI98 176 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ANHXE9PGG2 379 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 H0Y980 276 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 H3BMQ9 156 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 K7ERI5 159 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 M0QZ92 97 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLC1A7O00341 560 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 HSD17B6O14756 317 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ACOX3O15254 700 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLC31A1O15431 190 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ATP8B1O43520 1251 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 IDH3BO43837 385 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RAMP1O60894 148 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 OAS1P00973 400 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 TIMP1P01033 207 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SLPIP03973 132 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 C2P06681 752 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CALM1P0DP23 149 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CALM2P0DP24 149 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 CALM3P0DP25 149 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ATF6P18850 670 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ATP6V1B2P21281 511 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LMO1P25800 156 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 RFC3P40938 356 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 FUT6P51993 359 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 LBX1P52954 281 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 GAS1P54826 345 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 FBXW4P57775 412 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 ERVS71-1P61550 626 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 C2orf54Q08AI8 447 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SMARCB1Q12824 385 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-232ENST00000552331 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms