RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 EPYCQ99645 322 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 RHCGQ9UBD6 479 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 UPB1Q9UBR1 384 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 RASD1Q9Y272 281 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 J3KTA2 159 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 GMNNO75496 209 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 VAMP5O95183 116 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 HPRP00739 348 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 HRGP04196 525 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 T-ENOLP0DO92 83 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 ZNF43P17038 809 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 AHCYP23526 432 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 IL32P24001 234 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 CLDN17P56750 224 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 LGALS3BPQ08380 585 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 PMS2P3Q13401 168 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 P2RY6Q15077 328 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 IFI44LQ53G44 452 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 NIPAL3Q6P499 406 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 C16orf89Q6UX73 402 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 RINLQ6ZS11 566 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 OXGR1Q96P68 337 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 ASPNQ9BXN1 380 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 ASB6Q9NWX5 421 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 CD300AQ9UGN4 299 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-217ENST00000550044 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 CIB4A0PJX0 185 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 C11orf98E9PRG8 122 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 PLPP3O14495 311 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 RAD51DO75771 328 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 SERPINI2O75830 405 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 KRT33AO76009 404 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 ALX3O95076 343 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 OR5F1O95221 314 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 IFNA2P01563 188 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 IFNW1P05000 195 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 UMPSP11172 480 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 HLA-DOBP13765 273 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 HSD17B1P14061 328 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 PPP3CBP16298 524 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 CRYGSP22914 178 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 SELENOPP49908 381 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 MNAT1P51948 309 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 STK11Q15831 433 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 OR6S1Q8NH40 331 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 PFN4Q8NHR9 129 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 TMEM45BQ96B21 275 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 TXNDC15Q96J42 360 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 MPP4Q96JB8 637 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 EMC6Q9BV81 110 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 V9GYQ6 96 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PR80 420 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 F8W735 103 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 FFAR1O14842 300 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 PIP5K1CO60331 668 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 UPK3AO75631 287 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 OR6A2O95222 327 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 GOSR1O95249 250 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 MT-ATP6P00846 226 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 MT-ND1P03886 318 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-217ENST00000550044 HIST1H2ABP04908 130 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms