RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 A0A1W2PR80 420 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 SHISA9B4DS77 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 SLC43A1O75387 559 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 ZNF432O94892 652 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 DANCRP0C864 163 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 CD40P25942 277 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 IL1RL1Q01638 556 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 UEVLDQ8IX04 471 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 NEUROG1Q92886 237 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 BDH2Q9BUT1 245 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-209ENST00000533069 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 M0R1B8 84 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 UPK3AO75631 287 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 SOD3P08294 240 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 CBLP22681 906 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 SMIM11AP58511 58 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 LTBQ06643 244 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 PUDPQ08623 228 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 PMS2P3Q13401 168 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 RCN1Q15293 331 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 SLC22A25Q6T423 547 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 C18orf12Q96KH6 178 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 OR2M2Q96R28 347 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 MS4A18H0YCH9 400 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 OVOL3O00110 214 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 KRT36O76013 467 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 LYPD3O95274 346 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ATP6V1G2O95670 118 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 RHCEP18577 417 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 LGALS3BPQ08380 585 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ATP6AP1Q15904 470 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 PGGHGQ32M88 737 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 PXKQ7Z7A4 578 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 CARM1Q86X55 608 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 TMEM123Q8N131 208 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 OR5J2Q8NH18 312 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 C7orf34Q96L11 122 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ZNF426Q9BUY5 554 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 FKRPQ9H9S5 495 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 C8orf4Q9NR00 106 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 MTORP42345 2549 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 VPS13CQ709C8 3753 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 H3BNX3 289 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 PLPP3O14495 311 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 HPRP00739 348 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 CST1P01037 141 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 THY1P04216 161 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 THRBP10828 461 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 PTNP21246 168 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ARHGDIAP52565 204 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ATP5J2P56134 94 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 SLC34A1Q06495 639 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ETFDHQ16134 617 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-209ENST00000533069 ZNF74Q16587 644 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms