RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	CDC14C	A4D256	554 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PRKCA	P17252	672 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	STOM	P27105	288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	EGR3	Q06889	387 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	VWA2	Q5GFL6	755 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OR51J1	Q9H342	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	SULT1B1	O43704	296 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	FOLR1	P15328	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PGC	P20142	388 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ARL4D	P49703	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	CCR6	P51684	374 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PNLIPRP2	P54317	469 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	DMWD	Q09019	674 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	HSPB2	Q16082	182 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OMA1	Q96E52	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF432	O94892	652 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	MT-ND4	P03905	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ADRA2C	P18825	462 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	MNDA	P41218	407 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	NSDHL	Q15738	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	GSG1	Q2KHT4	349 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	BTBD16	Q32M84	506 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	OR6C76	A6NM76	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PHYH	O14832	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	AKR7A2	O43488	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	FADS1	O60427	444 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	NPIPB7	O75200	414 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF254	O75437	659 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	WISP1	O95388	367 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	GP1BB	P13224	206 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ITPKB	P27987	946 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PTH2R	P49190	550 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	SGCB	Q16585	318 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	C6orf183	Q5T699	404 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	LINGO2	Q7L985	606 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	EID2	Q8N6I1	236 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FADS3-208	ENST00000529404		A0A1B0GTH9	108 aa		13.71	□□□□□ -0.22
FADS3-208	ENST00000529404	FABP7	O15540	132 aa		13.71	□□□□□ -0.22
FADS3-208	ENST00000529404	DUX1	O43812	170 aa		13.71	□□□□□ -0.22
FADS3-208	ENST00000529404	RAF1	P04049	648 aa		13.71	□□□□□ -0.22
FADS3-208	ENST00000529404	ABCD3	P28288	659 aa		13.71	□□□□□ -0.22
FADS3-208	ENST00000529404	CSF2RB	P32927	897 aa		13.71	□□□□□ -0.22
FADS3-208	ENST00000529404	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
FADS3-208	ENST00000529404	CCR9	P51686	369 aa		13.71	□□□□□ -0.22

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