RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-207ENST00000527677 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-207ENST00000527677 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-207ENST00000527677 PDLIM1O00151 329 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 HMGN1P05114 100 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 NOS3P29474 1203 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SIRPAP78324 504 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 NIPAL3Q6P499 406 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 KIF18BQ86Y91 864 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 LNX2Q8N448 690 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SAMD8Q96LT4 415 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF570Q96NI8 536 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 OR2M2Q96R28 347 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 DOCK7Q96N67 2140 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SLC35F4A4IF30 521 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SERPINI2O75830 405 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ATP6V1G2O95670 118 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 CGAP01215 116 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 IFNGP01579 166 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 HLA-DOBP13765 273 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ACADSP16219 412 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 BMP5P22003 454 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 GRK5P34947 590 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 CRISP1P54107 249 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 BIDP55957 195 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 FXYD6P3P58550 94 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ITGADQ13349 1161 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 P2RY6Q15077 328 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 BEND4Q6ZU67 534 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 FAM122BQ7Z309 247 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 TMEM123Q8N131 208 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 MED29Q9NX70 200 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 JKAMPQ9P055 326 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 MALT1Q9UDY8 824 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.82□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 H0YJX3 145 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 BHLHE40O14503 412 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SOCS2O14508 198 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 KRT33AO76009 404 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 AGFG2O95081 481 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SOX14O95416 240 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 GIPRP48546 466 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 CSNK1A1P48729 337 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ASCL1P50553 236 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ERVK-25P63136 954 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 VWA1Q6PCB0 445 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 Q6ZT83 130 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF519Q8TB69 540 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 UPB1Q9UBR1 384 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 M0R3G1 203 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 PPP1R3DO95685 299 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 PGA4P0DJD7 388 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 PGA3P0DJD8 388 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 POU1F1P28069 291 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 PEX2P28328 305 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 ACVR1BP36896 505 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 PEX19P40855 299 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-207ENST00000527677 SELENOPP49908 381 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms