RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519342.1

RNF19A-204, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene RNF19A, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-204	ENST00000519342	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	MED29	Q9NX70	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	CENPE	Q02224	2701 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342		A0A087WUU8	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	PRSS23	O95084	383 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	CLRN1	P58418	232 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	VLDLR	P98155	873 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	GLTP	Q9NZD2	209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342		V9GYQ6	96 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342		A6NIZ1	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	CLOCK	O15516	846 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	UBOX5	O94941	541 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	F13B	P05160	661 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	AQP2	P41181	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ZNF84	P51523	738 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	RAP1B	P61224	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	RAP1A	P62834	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	SPIB	Q01892	262 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342		M0R1B8	84 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	HS3ST1	O14792	307 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	SIAH2	O43255	324 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ACADS	P16219	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	RRM2	P31350	389 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ARR3	P36575	388 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ZNF83	P51522	516 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	GK3P	Q14409	553 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ZBED5	Q49AG3	693 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	FBXW5	Q969U6	566 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	RBP7	Q96R05	134 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	FOXC2	Q99958	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	MPDZ	O75970	2070 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RNF19A-204	ENST00000519342	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	ABCD4	O14678	606 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	AHCYL1	O43865	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	PIP5K1C	O60331	668 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	PDE5A	O76074	875 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	SEMG1	P04279	462 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	MAK	P20794	623 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	CD40	P25942	277 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	CAPZA2	P47755	286 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	IST1	P53990	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	CTXN1	P60606	82 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNF19A-204	ENST00000519342	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25

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