RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC9A3R2Q15599 337 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C12orf60Q5U649 245 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAET1GQ6H3X3 334 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM205Q6UW68 189 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC00696Q6ZRV3 163 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CACNG8Q8WXS5 425 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEC22CQ9BRL7 303 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC35A5Q9BS91 424 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GABARAPL3Q9BY60 117 aa-0.64□□□□□ -2.51
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB17Q9H0T7 212 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PALMDQ9NP74 551 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ASF1BQ9NVP2 202 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP-0.64□□□□□ -2.51
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 P2RX2Q9UBL9 471 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPACA6W5XKT8 324 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADGRB3O60242 1522 aa-0.64□□□□□ -2.51
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 UGT1A9O60656 530 aa-0.65□□□□□ -2.51
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRDX4Q13162 271 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CARTPTQ16568 116 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MICBQ29980 383 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GID4Q8IVV7 300 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZADH2Q8N4Q0 377 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF563Q8TA94 476 aa-0.65□□□□□ -2.51
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RACGAP1Q9H0H5 632 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHBGQ9H310 441 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UGT1A7Q9HAW7 530 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UGT1A10Q9HAW8 530 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UGT1A8Q9HAW9 530 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNIP1Q9NZI2 227 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF492Q9P255 531 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR51B4Q9Y5P0 310 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HIP1O00291 1037 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KMOO15229 486 aa-0.66□□□□□ -2.52
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBXA2RP21731 343 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STX1BP61266 288 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TYSND1Q2T9J0 566 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAJC24Q6P3W2 148 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF546Q86UE3 836 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SERPINA12Q8IW75 414 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HTR3CQ8WXA8 447 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf50Q9BV19 199 aa-0.66□□□□□ -2.52
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C19orf71A6NCJ1 209 aa-0.67□□□□□ -2.52
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STX7O15400 261 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STX6O43752 255 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CXCL14O95715 111 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OPN1LWP04000 364 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMB5P28074 263 aa-0.67□□□□□ -2.52
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSPA2P54652 639 aa-0.67□□□□□ -2.52
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 AQP6Q13520 282 aa-0.67□□□□□ -2.52
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 PON3Q15166 354 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM16LQ309B1 348 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGGHGQ32M88 737 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABHD13Q7L211 337 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC16A13Q7RTY0 426 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF101Q8IZC7 436 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LEMD2Q8NC56 503 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACTR6Q9GZN1 396 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
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