RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 SLC6A7Q99884 636 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 LRP5LA4QPB2 252 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 RAB36O95755 333 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 FAM153BP0C7A2 387 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 COL8A2P25067 703 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SELENOPP49908 381 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MVDP53602 400 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 GALK2Q01415 458 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CHRNEQ04844 493 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF154Q13106 437 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 IL23RQ5VWK5 629 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 LEG1Q6P5S2 330 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SPG11Q96JI7 2443 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 AP3D1O14617 1153 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 IL6P05231 212 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MYZAPP0CAP1 466 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF43P17038 809 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CRISP3P54108 245 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 EGR4Q05215 589 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PDCD1Q15116 288 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 GPR68Q15743 365 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 AANATQ16613 207 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM225Q6GV28 225 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF613Q6PF04 617 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 Q6YL49 198 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC103Q8IW40 242 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 Q8TCH9 128 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MGARPQ8TDB4 240 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SAMD8Q96LT4 415 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 NPTNQ9Y639 398 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 VPS13CQ709C8 3753 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 A0A087WUJ7 227 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MS4A18H0YCH9 400 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 KRT33AO76009 404 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 NCR1O76036 304 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 HPXP02790 462 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MMP15P51511 669 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SLC18A1P54219 525 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 COPZ1P61923 177 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MSMPQ1L6U9 139 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ULK3Q6PHR2 472 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 COPEO14579 308 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MPZL1O95297 269 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 LIPFP07098 398 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 OR12D1P0DN82 309 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 THRBP10828 461 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 GATA4P43694 442 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 OR7A5Q15622 319 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SLC36A2Q495M3 483 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 UEVLDQ8IX04 471 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 MRI1Q9BV20 369 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-210ENST00000503258 ASPNQ9BXN1 380 aa6.54□□□□□ -1.36
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