RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 COL12A1Q99715 3063 aa6.61□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 A0A1B0GTH9 108 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 A0A1B0GUH1 482 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ZAR1LA6NP61 321 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 J3KTA2 159 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 FFAR1O14842 300 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 CHP2O43745 196 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 EFNA2O43921 213 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 WDR1O75083 606 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 FKBP6O75344 327 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 DIRAS1O95057 198 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 OR5F1O95221 314 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 LYPD3O95274 346 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 MT-ND1P03886 318 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 THY1P04216 161 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 THRBP10828 461 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 PNMTP11086 282 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 CPN1P15169 458 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 CCNA2P20248 432 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 AGAP20933 346 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 CXCR1P25024 350 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 IFNA8P32881 189 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 PTGS2P35354 604 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 MAGEA2P43356 314 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 CDH12P55289 794 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 DGCR2P98153 550 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 HSF1Q00613 529 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ST3GAL3Q11203 375 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SELENBP1Q13228 472 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 MTFR2Q6P444 385 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 VWA1Q6PCB0 445 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 DTX2Q86UW9 622 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SLC38A4Q969I6 547 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF347Q96SE7 839 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 PIP5K1AQ99755 562 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 CHID1Q9BWS9 393 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 C12orf10Q9HB07 376 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 RHCGQ9UBD6 479 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.6□□□□□ -1.35
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GARNL3-222ENST00000498801 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 A0A087WUJ7 227 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM72A0PK05 275 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 GJE1A6NN92 205 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF208O43345 1280 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ENTPD5O75356 428 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 LDLRP01130 860 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 OPN1LWP04000 364 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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GARNL3-222ENST00000498801 PEPDP12955 493 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 GABRA1P14867 456 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF708P17019 499 aa6.59□□□□□ -1.35
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GARNL3-222ENST00000498801 STARP49675 285 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 LHX2P50458 406 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SPIBQ01892 262 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 FHL3Q13643 280 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 TIGD6Q17RP2 521 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 DCST1Q5T197 706 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SMPDL3BQ92485 455 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 SARAFQ96BY9 339 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 MPP4Q96JB8 637 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 KLHL15Q96M94 604 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 TIMP4Q99727 224 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 YY1AP1Q9H869 796 aa6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GARNL3-222ENST00000498801 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.59□□□□□ -1.35
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