RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 TIMP4Q99727 224 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PI4KAP42356 2102 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SERINC4A6NH21 518 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SMLR1H3BR10 107 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RNF13O43567 381 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FMO6PO60774 539 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PPM1BO75688 479 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SOX30O94993 753 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 WISP1O95388 367 aa6.38□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 PEPDP12955 493 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HK1P19367 917 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A6P31641 620 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CD226Q15762 336 aa6.38□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 CNIH2Q6PI25 160 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SYT9Q86SS6 491 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.38□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 OR52N1Q8NH53 320 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR5W2Q8NH69 310 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SMPDL3BQ92485 455 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ADOQ96SZ5 270 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CCDC32Q9BV29 185 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ST8SIA5O15466 376 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ERVK-25P63136 954 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IL18Q14116 193 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FGFBP1Q14512 234 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF550Q7Z398 422 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CDH26Q8IXH8 852 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 THAP4Q8WY91 577 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RASD2Q96D21 266 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NMNAT3Q96T66 252 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 POLE3Q9NRF9 147 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MED12Q93074 2177 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TLCD2A6NGC4 264 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TTLL8A6PVC2 850 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CSF3P09919 207 aa6.37□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 RFX2P48378 723 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CTBP2P56545 445 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR10A3P58181 314 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SCN1BQ07699 218 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TOMM20Q15388 145 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SGCAQ16586 387 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 APOOLQ6UXV4 268 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 TIGD4Q8IY51 512 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR5J2Q8NH18 312 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A6Q92536 515 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 AP3S1Q92572 193 aa6.37□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 NDC1Q9BTX1 674 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.37□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 CUTCQ9NTM9 273 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MLXQ9UH92 298 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SGCEO43556 437 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A5O76082 557 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NDUFB2O95178 105 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IFNGP01579 166 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MT-ND5P03915 603 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PTGER4P35408 488 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MAP2K6P52564 334 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SSTP61278 116 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FHL1Q13642 323 aa6.37□□□□□ -1.39
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