RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	LAT2	Q9GZY6	243 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	MMP28	Q9H239	520 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	DKK4	Q9UBT3	224 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PRODH2	Q9UF12	536 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		5.25	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PPK0	400 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PRG6	482 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM72	A0PK05	275 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC36	A6NLP5	189 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730		H7C1C5	153 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMD9	O00233	223 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CASK	O14936	926 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ARPC3	O15145	178 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	T	O15178	435 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	NKX2-8	O15522	239 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ABHD16A	O95870	558 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PTTG1	O95997	202 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	MT-ND5	P03915	603 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	HLA-DPB1	P04440	258 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	F13B	P05160	661 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	LIPC	P11150	499 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	UBL4A	P11441	157 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	LIF	P15018	202 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	IL11	P20809	199 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	F8A1	P23610	371 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CD82	P27701	267 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ADH6	P28332	368 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	GRPR	P30550	384 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP6V1E1	P36543	226 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	KIR2DL3	P43628	341 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	MTNR1B	P49286	362 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC16A1	P53985	500 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TPTE	P56180	551 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	LCN6	P62502	163 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CBX3	Q13185	183 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ASAH1	Q13510	395 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR50	Q13585	617 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CDON	Q4KMG0	1287 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	MEST	Q5EB52	335 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	XKRX	Q6PP77	449 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CDK20	Q8IZL9	346 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ESX1	Q8N693	406 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CT55	Q8WUE5	264 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OMA1	Q96E52	524 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TXNDC15	Q96J42	360 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP6	Q96JE9	813 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1F2P	Q96R84	312 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	AMELY	Q99218	206 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	LPAR4	Q99677	370 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	MMP25	Q9NPA2	562 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	BRD7	Q9NPI1	651 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	IL17B	Q9UHF5	180 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		5.24	□□□□□ -1.57
C4BPB-208	ENST00000492730	POLH	Q9Y253	713 aa		5.24	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms