RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484054.3

RHOC-215, Transcript of ras homolog family member C, human

TSL 5

Gene RHOC, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOC-215	ENST00000484054	HOXC12	P31275	282 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	AQP2	P41181	271 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	NR1H2	P55055	460 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	BID	P55957	195 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	SPIB	Q01892	262 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	LGALS3BP	Q08380	585 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	GABRA6	Q16445	453 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	OAF	Q86UD1	273 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	CDC20B	Q86Y33	519 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	OR6X1	Q8NH79	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	FOXC2	Q99958	501 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	DLL4	Q9NR61	685 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054		M0R3G1	203 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	F13B	P05160	661 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	TSPAN19	P0C672	248 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	SLC9A3	P48764	834 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	CHRNB3	Q05901	458 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	TMEM123	Q8N131	208 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	GPR35	Q9HC97	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	AURKC	Q9UQB9	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RHOC-215	ENST00000484054	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	ACOT8	O14734	319 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	GSC2	O15499	205 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	CLOCK	O15516	846 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	SIAH2	O43255	324 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	KRT36	O76013	467 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	WNT11	O96014	354 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	RRM2	P31350	389 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	IFNGR2	P38484	337 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	GPR4	P46093	362 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	CSNK1A1	P48729	337 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	PRPS1	P60891	318 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	MELK	Q14680	651 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	TAF11	Q15544	211 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	OR51A7	Q8NH64	312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	ZNF566	Q969W8	418 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	BOD1	Q96IK1	185 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	CRLF2	Q9HC73	371 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	ROS1	P08922	2347 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	CAD	P27708	2225 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	IGHG1	P01857	330 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	PAX7	P23759	505 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	OMP	P47874	163 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RHOC-215	ENST00000484054	CLRN1	P58418	232 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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