RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 DUSP7Q16829 419 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 GSG1Q2KHT4 349 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 RETREG3Q86VR2 466 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SNX32Q86XE0 403 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 PTOV1Q86YD1 416 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 OR5J2Q8NH18 312 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 PROX1Q92786 737 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35B4Q969S0 331 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TPD52L3Q96J77 140 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 PLK3Q9H4B4 646 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 C12orf10Q9HB07 376 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 NANSQ9NR45 359 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 DUSP13Q9UII6 198 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 LYNX1G3V0Z9 82 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 PLPP3O14495 311 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 MRASO14807 208 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TGFAP01135 160 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 LYNX1P0DP58 116 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 DAOP14920 347 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 PCGF2P35227 344 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 OR1E2P47887 323 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ARFIP2P53365 341 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 CLRN1P58418 232 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TAS2R41P59536 307 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 HGFACQ04756 655 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 RBBP4Q09028 425 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 RAB39AQ14964 217 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 MST1LQ2TV78 715 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 RABL3Q5HYI8 236 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf52Q5T4I8 152 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF613Q6PF04 617 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf89Q6UWU4 347 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 C20orf196Q8IYI0 205 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM123Q8N131 208 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SYT14Q8NB59 555 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TAMM41Q96BW9 452 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGDIGQ99819 225 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SYT3Q9BQG1 590 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 NELFAQ9H3P2 528 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 CMAHPQ9Y471 501 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PPW3 197 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PRG6 482 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 LRP5LA4QPB2 252 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 CHP2O43745 196 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 LMX1BO60663 402 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 BCL10O95999 233 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 MT-ATP6P00846 226 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 F13BP05160 661 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 FAM157BP0CG42 384 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 CCL2P13500 99 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 CCNOP22674 350 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 ALDH3B1P43353 468 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 NR4A2P43354 598 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 RAB1AP62820 205 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 CCNIQ14094 377 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 NPTX1Q15818 432 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 VMACQ2NL98 169 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-209ENST00000480420 FAM166AQ6J272 317 aa6.99□□□□□ -1.29
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