RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 BOD1Q96IK1 185 aa11.34□□□□□ -0.59
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HPS1-211ENST00000478087 ZNF525Q8N782 197 aa11.31□□□□□ -0.6
HPS1-211ENST00000478087 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa11.31□□□□□ -0.6
HPS1-211ENST00000478087 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HPS1-211ENST00000478087 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.31□□□□□ -0.6
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