RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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SHQ1-205ENST00000468371 TAS2R10Q9NYW0 307 aa5.46□□□□□ -1.54
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SHQ1-205ENST00000468371 CACNG2Q9Y698 323 aa5.46□□□□□ -1.54
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SHQ1-205ENST00000468371 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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SHQ1-205ENST00000468371 NGBQ9NPG2 151 aa5.45□□□□□ -1.54
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SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GTH9 108 aa5.45□□□□□ -1.54
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SHQ1-205ENST00000468371 HES5Q5TA89 166 aa5.45□□□□□ -1.54
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SHQ1-205ENST00000468371 Q6ZS92 163 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 GATSQ8NAP1 163 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 OR5P2Q8WZ92 322 aa5.45□□□□□ -1.54
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