RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF724A8MTY0 619 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 MCIDASD6RGH6 385 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR171O14626 319 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ZG16O60844 167 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO24O75426 580 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFSF13O75888 250 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 VAMP5O95183 116 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 TSPAN19P0C672 248 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF43P17038 809 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 BMP5P22003 454 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 EDNRAP25101 427 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 AGTR1P30556 359 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 UQCRC1P31930 480 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC9A3P48764 834 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 DAPP51397 102 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC16A1P53985 500 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDN17P56750 224 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 FXYD6P3P58550 94 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 CTXN1P60606 82 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ERVK-25P63136 954 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 PDK3Q15120 406 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 GUSBP1Q15486 140 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 PXKQ7Z7A4 578 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 KIF18BQ86Y91 864 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 UEVLDQ8IX04 471 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SVOPLQ8N434 492 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 STARD4Q96DR4 205 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SAMD8Q96LT4 415 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 CIB1Q99828 191 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 EMC6Q9BV81 110 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 BCO1Q9HAY6 547 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 INIPQ9NRY2 104 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 GLRX2Q9NS18 164 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 MED29Q9NX70 200 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 EMC3Q9P0I2 261 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 HCFC1P51610 2035 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFB2O95178 105 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SOX14O95416 240 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT11O96014 354 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAP00813 363 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 CRHP06850 196 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ANXA8P13928 327 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 IFNGR1P15260 489 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 GSTM3P21266 225 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 OPRM1P35372 400 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SMSP52788 366 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 BIDP55957 195 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPS1P60891 318 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 LGALS3BPQ08380 585 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 MELKQ14680 651 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 CDSNQ15517 529 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 MSMPQ1L6U9 139 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ALG10Q5BKT4 473 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 CARD17Q5XLA6 110 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 LPCAT4Q643R3 524 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 MTFR2Q6P444 385 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 NIPAL3Q6P499 406 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 FAHD1Q6P587 224 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 AAED1Q7RTV5 226 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 FANK1Q8TC84 345 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.45□□□□□ -1.22
ANKRD28-208ENST00000463533 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms