RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 EMC6Q9BV81 110 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF9O43307 516 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CYTIPO60759 359 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 TNFAIP8O95379 198 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ACVR2AP27037 513 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NXNL2Q5VZ03 156 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CREB3L2Q70SY1 520 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 JAZF1Q86VZ6 243 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ABHD3Q8WU67 409 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 FAR1Q8WVX9 515 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 Q96MT0 163 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SH3D21A4FU49 640 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 OR14I1A6ND48 311 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 AQP8O94778 261 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SYNGR4O95473 234 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CCDC159P0C7I6 412 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CLUP10909 449 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 BIDP55957 195 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 KLRB1Q12918 225 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 KRTCAP3Q53RY4 240 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PCSK4Q6UW60 755 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ADCK1Q86TW2 530 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZIC4Q8N9L1 334 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 RNF128Q8TEB7 428 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 XKRYO14609 159 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PAICSP22234 425 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 TDGF1P3P51864 188 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 LY6DQ14210 128 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 CHMP1BQ7LBR1 199 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 SGCDQ92629 289 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 ZNF696Q9H7X3 374 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NME4-209ENST00000460297 PRSS37A4D1T9 235 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 CLCA1A8K7I4 914 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 PRODHO43272 600 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 FAM20BO75063 409 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 GYPBP06028 91 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SLC2A5P22732 501 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SLC16A1P53985 500 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 CLDN17P56750 224 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 NIPAL3Q6P499 406 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 PM20D2Q8IYS1 436 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 OR5M9Q8NGP3 310 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SLC35F4A4IF30 521 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 TRIM64A6NGJ6 449 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 A6NIZ1 184 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SFTPCP11686 197 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 RAP1BP61224 184 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 RAP1AP62834 184 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 CSNK2BP67870 215 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 FAM205BPQ63HN1 556 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 TSSK2Q96PF2 358 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SNX18Q96RF0 628 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 KCNK17Q96T54 332 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SLX1AQ9BQ83 275 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SYT4Q9H2B2 425 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 OR51V1Q9H2C8 321 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 ASB6Q9NWX5 421 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SPTA1P02549 2419 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 DCTN6O00399 190 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 TRMUO75648 421 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 CDH11P55287 796 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 ZNF91Q05481 1191 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 OR6X1Q8NH79 312 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 ZNRF4Q8WWF5 429 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 GGHQ92820 318 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 ASF1BQ9NVP2 202 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 SLC22A23A1A5C7 686 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 PTGES3LE9PB15 166 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 TGM6O95932 706 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 RENP00797 406 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NME4-209ENST00000460297 NTF4P34130 210 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms