RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 TAS2R5Q9NYW4 299 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CXCR6O00574 342 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NME4O00746 187 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CSNK1A1P48729 337 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 SELENOWP63302 87 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NPRL3Q12980 569 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 TNK1Q13470 666 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF544Q6NX49 715 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM239Q8WW34 195 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 LRR1Q96L50 414 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 SEC61A2Q9H9S3 476 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CRYAAP02489 173 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 MT-ND1P03886 318 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CELA3BP08861 270 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CECR9P0C854 216 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 LSP1P33241 339 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 YAP1P46937 504 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 NHLRC1Q6VVB1 395 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF813Q6ZN06 617 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 VTCN1Q7Z7D3 282 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 HTRA1Q92743 480 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 CMTM5Q96DZ9 223 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 SGTBQ96EQ0 304 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ZFHX3Q15911 3703 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-210ENST00000440825 ASAH2BP0C7U1 165 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CD79AP11912 226 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FUT1P19526 365 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 DRD4P21917 467 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 RBM34P42696 430 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 GSK3BP49841 420 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 C11orf71Q6IPW1 123 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 VHLLQ6RSH7 139 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO17Q96EF6 278 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 C20orf141Q9NUB4 165 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PLCE1Q9P212 2302 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 SSX4O60224 188 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PIP5K1CO60331 668 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 OR7A10O76100 309 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 LY6G6DO95868 133 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PAX7P23759 505 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 IFNA8P32881 189 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 GNGT1P63211 74 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 NAAAQ02083 359 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 ZP4Q12836 540 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 ETFDHQ16134 617 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MDP1Q86V88 176 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FAM162AQ96A26 154 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 GRIP2Q9C0E4 1043 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 RHCGQ9UBD6 479 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MED31Q9Y3C7 131 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 GMNCA6NCL1 334 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FAM171A2A8MVW0 826 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 SNX3O60493 162 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 BCL10O95999 233 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 HLA-HP01893 362 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 F13BP05160 661 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 B4GALT1P15291 398 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CBR1P16152 277 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 NCK1P16333 377 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 NUDT6P53370 316 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PSME3P61289 254 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PIGFQ07326 219 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 ST3GAL3Q11203 375 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FKBP9P1Q75LS8 142 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 OR6X1Q8NH79 312 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF566Q969W8 418 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 PRRC1Q96M27 445 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 MCIDASD6RGH6 385 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 RNF223E7ERA6 249 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 J3KTA2 159 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 SERPINA1P01009 418 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 IFNW1P05000 195 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CALCRP30988 508 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CHRNB3Q05901 458 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 RAB35Q15286 201 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 HACD2Q6Y1H2 254 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC36Q8IYA8 594 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 FOXB1Q99853 325 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 GLTPQ9NZD2 209 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 A4GNTQ9UNA3 340 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 SNX13Q9Y5W8 968 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-210ENST00000440825 ALPK2Q86TB3 2170 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms