RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 COL4A2P08572 1712 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 SHOXO15266 292 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 OIP5O43482 229 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ZNF432O94892 652 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 RENP00797 406 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 DCTDP32321 178 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 EPHA4P54764 986 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 PUDPQ08623 228 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 SKP2Q13309 424 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 IKZF1Q13422 519 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 TCTE1Q5JU00 501 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CLLU1Q5K131 121 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 STPG1Q5TH74 334 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 COMMD7Q86VX2 200 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CDC20BQ86Y33 519 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 EXD3Q8N9H8 876 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 LIPHQ8WWY8 451 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 MARVELD3Q96A59 401 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 LPAR4Q99677 370 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 C17orf105B2RV13 164 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 I3L521 148 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ZNF264O43296 627 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 HIST1H2ABP04908 130 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 IGHV4-34P06331 123 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ADRA2CP18825 462 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ADH7P40394 386 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 MNDAP41218 407 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 LTBQ06643 244 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 SERTAD2Q14140 314 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 FZD2Q14332 565 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 EMC4Q5J8M3 183 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CBLN3Q6UW01 205 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 THEM6Q8WUY1 208 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 TCTN2Q96GX1 697 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 KLHL15Q96M94 604 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 MAP3K3Q99759 626 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 WDR76Q9H967 626 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 TAS2R5Q9NYW4 299 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 A0A1B0GTH9 108 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 G3V3Q6 166 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 DCTN6O00399 190 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ABHD16AO95870 558 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 TXNDC12O95881 172 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 PDGFAP04085 211 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ALDOBP05062 364 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CPN1P15169 458 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 IFNGR1P15260 489 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ITPKBP27987 946 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 BLKP51451 505 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 HTR4Q13639 388 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 GRK1Q15835 563 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ODF4Q2M2E3 257 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 MESTQ5EB52 335 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 SPICQ8N5J4 248 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 OR8K3Q8NH51 312 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 GPR148Q8TDV2 347 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 TMEM106AQ96A25 262 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 RBP7Q96R05 134 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 MNTQ99583 582 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 CLEC1BQ9P126 229 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-201ENST00000398741 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TMEM212A6NML5 194 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 H3BSH0 61 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ZNF254O75437 659 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 UTS2O95399 124 aa11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms