RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PCYOX1Q9UHG3 505 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB3Q9Y575 518 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 NSD2O96028 1365 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIAL4EA0A075B759 164 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 SNTNA6NMZ2 147 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CD5LO43866 347 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 FCMRO60667 390 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 B4GALT2O60909 372 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CSF3P09919 207 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 GKN3PP0CG01 181 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIAL4FP0DN26 164 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV3-43DP0DP04 118 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 FDFT1P37268 417 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS9P46781 194 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 NPBWR2P48146 333 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF136P52737 540 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTA1P68133 377 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PMF1Q6P1K2 205 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 UQCC3Q6UW78 93 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ZYG11AQ6WRX3 759 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 UTS2BQ765I0 119 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf56Q8IXR9 622 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 TPRX1Q8N7U7 411 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 Q8N976 141 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 STARD8Q92502 1023 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBGCP3Q96CW5 907 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC19Q96DA6 116 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PSKH2Q96QS6 385 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 TAAR1Q96RJ0 339 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PPA2Q9H2U2 334 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 EXD2Q9NVH0 621 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC4AQ9UMR7 237 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS37A4D1T9 235 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BNH8 94 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 AIREO43918 545 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL41O60662 606 aa2.28□□□□□ -2.04
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RABGGTB-202ENST00000370826 MED6O75586 246 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 OR7A10O76100 309 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IL1BP01584 269 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV2D-28P01615 120 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CNR1P21554 472 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CD1CP29017 333 aa2.28□□□□□ -2.04
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RABGGTB-202ENST00000370826 CCNA1P78396 465 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 OGDHQ02218 1023 aa2.28□□□□□ -2.04
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RABGGTB-202ENST00000370826 IL24Q13007 206 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IDI1Q13907 227 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CNIH2Q6PI25 160 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 LYPD2Q6UXB3 125 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PCP2Q8IVA1 136 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 OTUD6BQ8N6M0 293 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTRT1Q8TDG2 376 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF139Q8WU17 664 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 FOPNLQ96NB1 174 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PANX2Q96RD6 677 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ECSITQ9BQ95 431 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ANP32EQ9BTT0 268 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM62Q9BVG3 475 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS37BQ9H9H4 285 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 NMRAL1Q9HBL8 299 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAP2Q9NPF8 381 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 NMRK1Q9NWW6 199 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-202ENST00000370826 MSH6P52701 1360 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CARMIL3Q8ND23 1372 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa2.27□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 XKRY2A2RUG3 117 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVV-1B6SEH8 477 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA8SH3BPF8 625 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 XKRYO14609 159 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ANGPTL7O43827 346 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 UPK3AO75631 287 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TSPAN12O95859 305 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV2-5P01817 119 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FGF1P05230 155 aa2.27□□□□□ -2.05
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