RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 TRIB1Q96RU8 372 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 SLC30A3Q99726 388 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 ACPTQ9BZG2 426 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 BIN3Q9NQY0 253 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 DPM1O60762 260 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 C1SP09871 688 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 SLC35E2P0CK97 266 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 TGM1P22735 817 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 ITGAMP11215 1152 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF480Q8WV37 535 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 RAB3CQ96E17 227 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 DHRS9Q9BPW9 319 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 ZBP1Q9H171 429 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 RAB40ALP0C0E4 278 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 ACP2P11117 423 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 LCN6P62502 163 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 FOXC1Q12948 553 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 NLKQ9UBE8 527 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 DEGS1O15121 323 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 NAXDQ8IW45 347 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 FGGYQ96C11 551 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 DRD5P21918 477 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF91Q05481 1191 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.12□□□□□ -1.59
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