RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM131Q92545 1883 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CBFBQ13951 182 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 GATSQ8NAP1 163 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF417Q8TAU3 575 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 GSX2Q9BZM3 304 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 UBQLN4Q9NRR5 601 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 CA10Q9NS85 328 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 KCNN3Q9UGI6 736 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SPNS3-201ENST00000355530 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM212A6NML5 194 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 HSPB2A8KAH6 182 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SEMA4FO95754 770 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 HPGDP15428 266 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 HSD17B7P56937 341 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 LTBQ06643 244 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 EGR3Q06889 387 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ERV3-1Q14264 604 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OPCMLQ14982 345 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CD226Q15762 336 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 HSPB2Q16082 182 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MED25Q71SY5 747 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 LPAR4Q99677 370 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CDCP1Q9H5V8 836 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 WDR76Q9H967 626 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PLSCR5A0PG75 271 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ALDOBP05062 364 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PTHLHP12272 177 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 AANATQ16613 207 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 MESTQ5EB52 335 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 HMGB4Q8WW32 186 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 THRSPQ92748 146 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL15Q96M94 604 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PBX4Q9BYU1 374 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PPL8 197 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 DCTN6O00399 190 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SCDO00767 359 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 XRCC3O43542 346 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR2A4O95047 310 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CLPSP04118 112 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 F13BP05160 661 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 DRD1P21728 446 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CFPP27918 469 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ITPKBP27987 946 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 NUP54Q7Z3B4 507 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 GPR148Q8TDV2 347 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TSPAN32Q96QS1 320 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR2A7Q96R45 310 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 LMF1Q96S06 567 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CIB4A0PJX0 185 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR2M5A3KFT3 312 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 PHYHO14832 338 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OIP5O43482 229 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 RENP00797 406 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 CTSEP14091 401 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 GALNSP34059 522 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 EGR4Q05215 589 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 GRM7Q14831 915 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM106AQ96A25 262 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 KIF25Q9UIL4 384 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS3-201ENST00000355530 OR2W5A6NFC9 320 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms