RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL6Q8N531 539 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ELMOD3Q96FG2 381 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ACER3Q9NUN7 267 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 B8ZZF3 427 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SURF4O15260 269 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PIP5K1CO60331 668 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GIFP27352 417 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 IL10RAQ13651 578 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PGAP1Q75T13 922 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR13F1Q8NGS4 319 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LAT2Q9GZY6 243 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NOX3Q9HBY0 568 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FUOMA2VDF0 154 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 S100PP25815 95 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 AGAP6Q5VW22 663 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CD163Q86VB7 1156 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX19Q8NA77 164 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 AGAP4Q96P64 663 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RCE1Q9Y256 329 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R082 166 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT11O96014 354 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRA2P47869 451 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 B4GALNT1Q00973 533 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FCRL6Q6DN72 434 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C16orf52Q8NHV5 167 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ST8SIA1Q92185 356 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TSLPQ969D9 159 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZPBPQ9BS86 351 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DOCK1Q14185 1865 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN11A1L157 253 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 AKR7A3O95154 331 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PRPH2P23942 346 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PTGS2P35354 604 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MTFR2Q6P444 385 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 VHLLQ6RSH7 139 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NKAIN3Q8N8D7 197 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB3CQ96E17 227 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SELENBP1Q13228 472 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PFN4Q8NHR9 129 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 BTG2P78543 158 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SFXN4Q6P4A7 337 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SH2D5Q6ZV89 423 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF767PQ75MW2 155 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT8Q8WV74 236 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LRFN5Q96NI6 719 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MENTQ9BUN1 341 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CHST11Q9NPF2 352 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM166BA8MTA8 275 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX14O75381 377 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CPT2P23786 658 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf183Q5T699 404 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 EDEM2Q9BV94 578 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 H7C2Y5 167 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGAP37287 484 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MIB2Q96AX9 1013 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC61Q9BV99 259 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 P2RY10O00398 339 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF195O14628 629 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR137BO60478 399 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAMEF4O60810 478 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MT-ND4P03905 459 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SHC1P29353 583 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 VEGFCP49767 419 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 IKZF1Q13422 519 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HTR4Q13639 388 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5M11Q96RB7 305 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MFFQ9GZY8 342 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PNLIPRP2P54317 469 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms