RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 MCIDASD6RGH6 385 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF587BE7ETH6 402 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 PDLIM1O00151 329 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 E2F6O75461 281 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 UPK3AO75631 287 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 NDUFB2O95178 105 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 FCGR1AP12314 374 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 RPL4P36578 427 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 CAMK2DQ13557 499 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 ACKR1Q16570 336 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 FAM222BQ8WU58 562 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF566Q969W8 418 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 DACH2Q96NX9 599 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 KCNN3Q9UGI6 736 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 MGAT4BQ9UQ53 548 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 CIB4A0PJX0 185 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 ARRDC5A6NEK1 342 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 CENPBD1B2RD01 187 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 GASTP01350 101 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 FASP25445 335 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 CARD17Q5XLA6 110 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 OR7E24Q6IFN5 339 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 HMBOX1Q6NT76 420 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 SMARCD3Q6STE5 483 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 OR9Q2Q8NGE9 314 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 OR6N1Q8NGY5 312 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 LINC01560Q8TB33 94 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 BDH2Q9BUT1 245 aa23.59■■□□□ 1.37
CRIP1-201ENST00000330233 SH3D21A4FU49 640 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 LYZL6O75951 148 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 IGHMP01871 453 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 EPXP11678 715 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 GSTM3P21266 225 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 RPL27P61353 136 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 MELKQ14680 651 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 FAM205BPQ63HN1 556 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ZFP1Q6P2D0 407 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 OR10G2Q8NGC3 310 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ASB10Q8WXI3 467 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 NRBF2Q96F24 287 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 MED18Q9BUE0 208 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 DGCR6LQ9BY27 220 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ACTR6Q9GZN1 396 aa23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 HECTD1Q9ULT8 2610 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 CASKO14936 926 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 IGHG1P01857 330 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 CD14P08571 375 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ITGA5P08648 1049 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 CCKARP32238 428 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 CSNK1A1P48729 337 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 IST1P53990 364 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 LGALS3BPQ08380 585 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6AP1Q15904 470 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ARMC4Q5T2S8 1044 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD34AQ69YU3 496 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 P2RY8Q86VZ1 359 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 AQP11Q8NBQ7 271 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 HSD17B8Q92506 261 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 GPR35Q9HC97 309 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 GLTPQ9NZD2 209 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 CRIM1Q9NZV1 1036 aa23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 A6NIZ1 184 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 M0R3G1 203 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ACADSP16219 412 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 RAP1BP61224 184 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 RAP1AP62834 184 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 COX10Q12887 443 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 RFX4Q33E94 735 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 SSX8Q7RTT4 187 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 IGFN1Q86VF2 1251 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM54Q969K7 222 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 S100PBPQ96BU1 408 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 MUS81Q96NY9 551 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 KATNB1Q9BVA0 655 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 NTN4Q9HB63 628 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 CRLF2Q9HC73 371 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF226Q9NYT6 803 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 GRHPRQ9UBQ7 328 aa23.56■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 PGA4P0DJD7 388 aa23.55■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 PGA3P0DJD8 388 aa23.55■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 CLRN1P58418 232 aa23.55■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 TSC22D1Q15714 1073 aa23.55■■□□□ 1.36
CRIP1-201ENST00000330233 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms