RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 STX19Q8N4C7 294 aa18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ASB10Q8WXI3 467 aa18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 RNFT2Q96EX2 444 aa18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SNX18Q96RF0 628 aa18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MED29Q9NX70 200 aa18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVK-18Q9QC07 812 aa18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 LHX6Q9UPM6 363 aa18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK1P06493 297 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC2A5P22732 501 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LGALS3BPQ08380 585 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ST3GAL4Q11206 333 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 POU4F3Q15319 338 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PRSS48Q7RTY5 328 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 IRGMA1A4Y4 181 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM64CA6NLI5 447 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 H7C1C5 153 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 GYPBP06028 91 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CLUP10909 449 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LCN6P62502 163 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB40BQ12829 278 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TMED1Q13445 227 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL22Q53GT1 634 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 HDDC2Q7Z4H3 204 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT4Q9H2B2 425 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL13Q9P2N7 655 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SPRR3Q9UBC9 169 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PRSS37A4D1T9 235 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A1P53007 311 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SPARTQ8N0X7 666 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMP4Q99727 224 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 VCX3AQ9NNX9 186 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBD1Q9UJT1 453 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ATMQ13315 3056 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NPIPA2E9PIF3 369 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NPIPA3F8WFD2 350 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 STSP08842 583 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM87AP0C7U9 286 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CPN1P15169 458 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SPI1P17947 270 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 BIDP55957 195 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SIAH3Q8IW03 269 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 OR9K2Q8NGE7 335 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2T4Q8NH00 348 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LGALS12Q96DT0 336 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNDC15Q96J42 360 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TEAD3Q99594 435 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ASB6Q9NWX5 421 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ALPK2Q86TB3 2170 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CRYABP02511 175 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 MT-ND2P03891 347 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP6V1E1P36543 226 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NR1H2P55055 460 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC17A1Q14916 467 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35D3Q5M8T2 416 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LCN1P1Q5VSP4 162 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP1BQ7LBR1 199 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PNPLA2Q96AD5 504 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM80Q96HE8 168 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GVC2 190 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC182A6NF36 153 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNGR4O95473 234 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FADS2O95864 444 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 MVKQ03426 396 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RUNX1T1Q06455 604 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PON3Q15166 354 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00303Q3SY05 128 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD8Q6ZWB6 473 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FCRLAQ7L513 359 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SVOPQ8N4V2 548 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ROBO4Q8WZ75 1007 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 WDYHV1Q96HA8 205 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNK17Q96T54 332 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms