RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF511Q8NB15 262 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 PSMF1Q92530 271 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 DDAH2O95865 285 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 ITGB2P05107 769 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 LIPAP38571 399 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.16□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 PRAMEF25A6NGN4 478 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 ACER3Q9NUN7 267 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 GLTPQ9NZD2 209 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 PEX14O75381 377 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 BLOC1S1P78537 153 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 MEP1BQ16820 701 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 SLC36A2Q495M3 483 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 YIF1BQ5BJH7 314 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 COMMD7Q86VX2 200 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 LAX1Q8IWV1 398 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 NCR1O76036 304 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 SLC14A1Q13336 389 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 LRRC18Q8N456 261 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.15□□□□□ -0.62
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PTPRS-201ENST00000262963 F8W036 122 aa11.15□□□□□ -0.63
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PTPRS-201ENST00000262963 LIPCP11150 499 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 ABOP16442 354 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 ENPP1P22413 925 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 HOXD12P35452 270 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 GDNFP39905 211 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 CLDN6P56747 220 aa11.15□□□□□ -0.63
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PTPRS-201ENST00000262963 S100A12P80511 92 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.15□□□□□ -0.63
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PTPRS-201ENST00000262963 OR14K1Q8NGZ2 314 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 PBX4Q9BYU1 374 aa11.15□□□□□ -0.63
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PTPRS-201ENST00000262963 CHST8Q9H2A9 424 aa11.15□□□□□ -0.63
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PTPRS-201ENST00000262963 NTN4Q9HB63 628 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 TNFRSF10AO00220 468 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 HMGN4O00479 90 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 CD22P20273 847 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 NKAIN4Q8IVV8 208 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 RAB3CQ96E17 227 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM129A0AVI4 362 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM82A0PJX8 343 aa11.14□□□□□ -0.63
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