RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chmp1aQ921W0 196 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SostQ99P68 211 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr2Q9QWU6 327 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asah1Q9WV54 394 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pde4dipQ80YT7 2224 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 5430401F13RikE9Q328 175 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp2cbP62715 309 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp2caP63330 309 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Masp1P98064 704 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr39Q5U431 456 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 St6gal1Q64685 403 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf728Q6P5C7 752 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps27Q6ZWU9 84 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl35Q6ZWV7 123 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eci3Q78JN3 317 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zdhhc1Q8R0N9 484 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dusp15Q8R4V2 235 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr881Q8VF63 314 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hcfc1r1Q9CYQ5 120 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem35aQ9D328 167 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prl8a6Q9DAY2 240 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RlimQ9WTV7 600 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gstz1Q9WVL0 216 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col12a1Q60847 3120 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr152G3X9L8 316 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Creg1O88668 220 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NfyaP23708 346 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mmp12P34960 473 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh26P59862 763 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MplQ08351 625 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 St3gal2Q11204 350 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SynprQ8BGN8 265 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akr1c18Q8K023 323 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aimp2Q8R010 320 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr569Q8VGZ2 314 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B3galnt1Q920V1 331 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gabra4Q9D6F4 552 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem176bQ9R1Q6 263 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PlpbpQ9Z2Y8 274 aa14.8□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp873A0A1B0GT64 667 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr727A2RTN7 324 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930595D18RikD3Z642 64 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smpd5D6MZJ6 483 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2410141K09RikK7N769 464 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd1d1P11609 336 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd1d2P11610 336 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P18533 117 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acp2P24638 423 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sox7P40646 380 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csn1s2aQ02862 184 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P2ry10bQ8BY68 352 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4933402N03RikQ8CDT9 329 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plcz1Q8K4D7 647 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab38Q8QZZ8 211 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galnt11Q921L8 608 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pycr1Q922W5 309 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1338A2ACY7 313 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r101E9PZS9 857 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RaxO35602 342 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irs3O54718 495 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C4bpaP08607 469 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klk1P15947 261 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rce1P57791 329 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r123P59528 333 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttf1Q62187 859 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grm7Q68ED2 915 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc22a20Q80UJ1 556 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vrk1Q80X41 440 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dyrk3Q922Y0 586 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bex4Q9CWT2 118 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r53Q9EP93 310 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cnot9Q9JKY0 299 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phf3B2RQG2 2025 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1084A0A1L1STZ9 313 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcpp2E9PYC2 171 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcpp1L7N1X9 171 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01851 173 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01852 173 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Six5P70178 719 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 N6amt1Q6SKR2 214 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lin28aQ8K3Y3 209 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec2fQ8VI21 196 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slco1a6Q99J94 670 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lap3Q9CPY7 519 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mmp1bQ9EPL6 463 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sorcs2Q9EPR5 1159 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cts8Q9JI81 333 aa14.79□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr576A0A0G2JFH3 312 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1082A0A1L1SUC9 313 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp345A2AQA1 561 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lin7bO88951 207 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01667 111 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Camk2bP28652 542 aa14.78□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1caP62137 330 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35f3Q1LZI2 421 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.3 ms