RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, human

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ALMS1-208	ENST00000620466	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		7.71	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TMEM221	A6NGB7	291 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	SERINC4	A6NH21	518 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TEAD1	P28347	426 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	HCCS	P53701	268 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	EMP3	P54852	163 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TAS2R20	P59543	309 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	OPCML	Q14982	345 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	DUSP5	Q16690	384 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TMEM64	Q6YI46	380 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	ACBD4	Q8NC06	268 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PPA2	Q9H2U2	334 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	COPS3	Q9UNS2	423 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CYB5B	O43169	146 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	HR	O43593	1189 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CD22	P20273	847 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TAS2R19	P59542	299 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	DPT	Q07507	201 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	RAB31	Q13636	194 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	APH1B	Q8WW43	257 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TOMM40L	Q969M1	308 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	SURF4	O15260	269 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	OR8U9	P0C7N5	309 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	SERPINA2	P20848	420 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	NUDT1	P36639	197 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	OR6V1	Q8N148	313 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	RASD2	Q96D21	266 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	MED16	Q9Y2X0	877 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TRIP11	Q15643	1979 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466		A0A0A6YYJ9	748 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	MPIG6B	O95866	241 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	DLX5	P56178	289 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	EID2B	Q96D98	161 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CTRC	Q99895	268 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	IL21	Q9HBE4	155 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	DECR2	Q9NUI1	292 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	OR6C6	A6NF89	314 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466		B4DXG7	233 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	C1QB	P02746	253 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	DBH	P09172	617 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	UBB	P0CG47	229 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	SRM	P19623	302 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TAS2R31	P59538	309 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	MEF2D	Q14814	521 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	MOK	Q9UQ07	419 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PRRT4	C9JH25	899 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466		F8W036	122 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	PPP3CB	P16298	524 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	HOXA9	P31269	272 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF136	P52737	540 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	RAP2B	P61225	183 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	BTG1	P62324	171 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ALMS1-208	ENST00000620466	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18

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