RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 RAD51DO75771 328 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 VAMP5O95183 116 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF682O95780 498 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 MT-ATP6P00846 226 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 SERPINA1P01009 418 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 GPIP06744 558 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 DANCRP0C864 163 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 TNFRSF1BP20333 461 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 CXCR1P25024 350 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 OR1E2P47887 323 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 NCALDP61601 193 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ZP4Q12836 540 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 FAPQ12884 760 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF74Q16587 644 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 SSX8Q7RTT4 187 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 CADM2Q8N3J6 435 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM99Q8N816 258 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 LZICQ8WZA0 190 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 NEUROG1Q92886 237 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXW5Q969U6 566 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 MUCL1Q96DR8 90 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 PYURFQ96I23 114 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 BDH2Q9BUT1 245 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 FKRPQ9H9S5 495 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ASB6Q9NWX5 421 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ADA2Q9NZK5 511 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ZANQ9Y493 2812 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCA1O95477 2261 aa6.02□□□□□ -1.44
EFTUD2-210ENST00000588340 HIVEP2P31629 2446 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A087WUU8 490 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 CIB4A0PJX0 185 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM64BA6NI03 449 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 AQP12BA6NM10 295 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 C3orf80F5H4A9 247 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 MS4A18H0YCH9 400 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 H7C1Q1 480 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 OVOL3O00110 214 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 GSC2O15499 205 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP5HO75947 161 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 AKR7A3O95154 331 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 AHSA1O95433 338 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 HPRP00739 348 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 MT-ND1P03886 318 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 IFNW1P05000 195 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 SOD3P08294 240 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 ITGA5P08648 1049 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 RHCEP18577 417 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 UGT2B15P54855 530 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP5J2P56134 94 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 ST3GAL3Q11203 375 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 OR7A5Q15622 319 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 GABRA6Q16445 453 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 585 ms