RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ARMCX1Q9P291 453 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ARID1AO14497 2285 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 A0A096LPE4 126 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0B4J2E0 115 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GX12 115 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPZ6 126 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF726A6NNF4 738 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TPST2O60704 377 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TMCC2O75069 709 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 UPK3AO75631 287 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINI2O75830 405 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 KRT36O76013 467 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2ABP04908 130 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SOD3P08294 240 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FOSL1P15407 271 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CD247P20963 164 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 AHCYP23526 432 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CD40P25942 277 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GSTT1P30711 240 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CDH11P55287 796 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS3BPQ08380 585 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NRF1Q16656 503 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CARD17Q5XLA6 110 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF613Q6PF04 617 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RINLQ6ZS11 566 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 WDR31Q8NA23 367 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 STMN2Q93045 179 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TAMM41Q96BW9 452 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 C18orf12Q96KH6 178 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 BDH2Q9BUT1 245 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 BAG5Q9UL15 447 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SHISA9B4DS77 424 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LRRN3E7EW58 273 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf98E9PRG8 122 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 H7C1Q1 480 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 M0R3G1 203 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GSTA4O15217 222 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CHP2O43745 196 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FMO6PO60774 539 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CH25HO95992 272 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MT-ATP6P00846 226 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 INHBBP09529 407 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ADORA3P0DMS8 318 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 UMPSP11172 480 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ANPEPP15144 967 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN1AP38936 164 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CAPZA2P47755 286 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GZMMP51124 257 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FABP6P51161 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R41P59536 307 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ACTR3P61158 418 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LTBQ06643 244 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PUDPQ08623 228 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 VEZF1Q14119 521 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NPTX1Q15818 432 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 AGAP6Q5VW22 663 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 DEF8Q6ZN54 512 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC80Q76M96 950 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CARM1Q86X55 608 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms