RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582892.1

NF1-222, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 4

Gene NF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-222	ENST00000582892	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892		A0A0J9YY10	115 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	KCNK2	O95069	426 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	TSPAN19	P0C672	248 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ALOX12	P18054	663 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CERS1	P27544	350 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	GABRA5	P31644	462 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CD96	P40200	585 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	MC3R	P41968	323 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ASAH1	Q13510	395 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	RIN1	Q13671	783 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892		Q5PR19	223 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	AGAP6	Q5VW22	663 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	TMEM107	Q6UX40	140 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	RRM2B	Q7LG56	351 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SZRD1	Q7Z422	152 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	AKAP14	Q86UN6	197 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	GID4	Q8IVV7	300 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ASB5	Q8WWX0	329 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	UFD1	Q92890	307 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SLC35B4	Q969S0	331 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	RNFT2	Q96EX2	444 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SLC35A4	Q96G79	324 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SCMH1	Q96GD3	660 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892		Q96MF0	132 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	KCTD7	Q96MP8	289 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	STAC	Q99469	402 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CBLC	Q9ULV8	474 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CMAHP	Q9Y471	501 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892		V9GYH0	126 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ROS1	P08922	2347 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CR1	P17927	2039 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892		A6NNC1	897 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ISM1	B1AKI9	464 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	IDS	B3KWA1	339 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CTDSP2	O14595	271 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SURF4	O15260	269 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	KCNAB3	O43448	404 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	B3GALT2	O43825	422 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	PLOD3	O60568	738 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ATP6V1G1	O75348	118 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CRLF1	O75462	422 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	HLA-DQB1	P01920	261 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	HLA-DPB1	P04440	258 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ATP1B1	P05026	303 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CPM	P14384	443 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CPN2	P22792	545 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	HTR1F	P30939	366 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	PTGS2	P35354	604 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	SOX3	P41225	446 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	ETV1	P50549	477 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	PRKAG1	P54619	331 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	DCAF7	P61962	342 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	PPP3R1	P63098	170 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	BTN3A2	P78410	334 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NF1-222	ENST00000582892	CHRNE	Q04844	493 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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