RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPO2Q5TGU0 170 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 STAC2Q6ZMT1 411 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35D2Q76EJ3 337 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOSPD2Q8NHP6 518 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXNDC15Q96J42 360 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 INIPQ9NRY2 104 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A10Q9NS82 523 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASB6Q9NWX5 421 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 UPB1Q9UBR1 384 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf97H3BN30 126 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNGT2O14610 69 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF4O43474 513 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAP00813 363 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 F13BP05160 661 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNGR1P15260 489 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRPS1P60891 318 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBED5Q49AG3 693 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG10Q5BKT4 473 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf94Q6P1W5 598 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARMC1Q9NVT9 282 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKDREJQ9NTG1 2253 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PRG6 482 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC43A1O75387 559 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNB2O95067 398 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGADQ13349 1161 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2M2Q96R28 347 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMC6Q9BV81 110 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35F4A4IF30 521 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLOCKO15516 846 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCKARP32238 428 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAPQ12884 760 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 MICAQ29983 383 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPA33Q99795 319 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDHD5Q9BXW7 423 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00470Q9BZP3 86 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC24A3Q9HC58 644 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJB9Q9UBS3 223 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGLEC7Q9Y286 467 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR52Q9Y2T5 361 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP4S1Q9Y587 144 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF726A6NNF4 738 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX5AP20674 150 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 FPR3P25089 353 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF11Q15544 211 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFRP5Q5T4F7 317 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGBD2Q6P3X8 592 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM123Q8N131 208 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR9Q2Q8NGE9 314 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCCC2Q9HCC0 563 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBAL3A6NHL2 446 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPB13A6NJU9 1138 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPB4C9JG80 1138 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIPRLO75663 272 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL10O95999 233 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1-2P23083 117 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 BIDP55957 195 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC75AQ8NAA5 344 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6X1Q8NH79 312 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDEL1Q9GZM8 345 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNC119BA6NIH7 251 aa29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDLIM1O00151 329 aa29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT33AO76009 404 aa29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX6B1P14854 86 aa29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAP3P51398 398 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10A4Q9H209 315 aa29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R16Q9NYV7 291 aa29.2■■■□□ 2.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTP4A3O75365 173 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSSP48637 474 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN31Q12999 210 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 MELKQ14680 651 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACKR1Q16570 336 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRR1Q96L50 414 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDRG3Q9UGV2 375 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCIDASD6RGH6 385 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 E2F6O75461 281 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 UPK3AO75631 287 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFB2O95178 105 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DL3P43628 341 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 IST1P53990 364 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMK2DQ13557 499 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDDC2Q7Z4H3 204 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms