RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 HCFC1P51610 2035 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 PLPP3O14495 311 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 OR7A10O76100 309 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 HPRP00739 348 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ASAH2BP0C7U1 165 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SMIM18P0DKX4 95 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 IGFBP2P18065 325 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 FUT1P19526 365 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 OR3A2P47893 321 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 FAM27E3Q08E93 113 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 GK3PQ14409 553 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 FGD3Q5JSP0 725 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ACBD4Q8NC06 268 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 LIPHQ8WWY8 451 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 BPIFA2Q96DR5 249 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 E2F6O75461 281 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 CLPTM1O96005 669 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 IFI30P13284 250 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 HLA-DOBP13765 273 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 RPS6KA3P51812 740 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SPIBQ01892 262 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 PRKCDQ05655 676 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 NHLRC1Q6VVB1 395 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 STK32CQ86UX6 486 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC46Q96FV0 321 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 PRSS50Q9UI38 385 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 GADD45GO95257 159 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 HIST1H2ABP04908 130 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF23P17027 643 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF43P17038 809 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 MAKP20794 623 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 RRM2P31350 389 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SMIM11AP58511 58 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 PUDPQ08623 228 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SEC23BQ15437 767 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 BEND4Q6ZU67 534 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM45BQ96B21 275 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 NRBF2Q96F24 287 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 CIB1Q99828 191 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 REEP1Q9H902 201 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 FANCFQ9NPI8 374 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 PARPBPQ9NWS1 579 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ELOVL5Q9NYP7 299 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 OAZ3Q9UMX2 235 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 G3V2T6 193 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ADORA3P0DMS8 318 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 AHCYP23526 432 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 CD79BP40259 229 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 NR1H2P55055 460 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 IL1RL1Q01638 556 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 ZP4Q12836 540 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 APOFQ13790 326 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 CASP12Q6UXS9 341 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 RRM2BQ7LG56 351 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 AAED1Q7RTV5 226 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 GABRG1Q8N1C3 465 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 APH1AQ96BI3 265 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 NTN4Q9HB63 628 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SAC3D1A6NKF1 404 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 IGHV3-9P01782 118 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 POU2F1P14859 743 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 LIMS1P48059 325 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 PCYT1AP49585 367 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 HMGA2P52926 109 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 PXKQ7Z7A4 578 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 KIF18BQ86Y91 864 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 UEVLDQ8IX04 471 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SPOCK3Q9BQ16 436 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.84■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.83■□□□□ 0.13
SPNS1-208ENST00000566059 C11orf98E9PRG8 122 aa15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms